- 病原體基因檢測(cè)平臺(tái)
- 致病微生物溯源分析平臺(tái)
- 未知病原體檢測(cè)平臺(tái)
建設(shè)內(nèi)容
以新冠病毒基因庫(kù)為基礎(chǔ)，搭建首個(gè)供全國(guó)使用的病原體檢測(cè)分析平臺(tái)， 實(shí)現(xiàn)了全單位系統(tǒng)基因測(cè)序與分析技術(shù)力量的統(tǒng)籌與整合， 每秒鐘可接收1000株病毒的fasta文件，并且每小時(shí)可完成40株病毒的分析工作
建設(shè)成果
搭建了整合單位總部與全國(guó)所有地方分部的大型聯(lián)動(dòng)操作系統(tǒng)，同時(shí)滿足管理與業(yè)務(wù)需求，實(shí)現(xiàn)從科研層面落地到應(yīng)用報(bào)告的轉(zhuǎn)化。
建立獨(dú)立自主的病毒數(shù)據(jù)庫(kù)，與國(guó)際主流數(shù)據(jù)庫(kù)同步更新，確保生物數(shù)據(jù)安全，防止數(shù)據(jù)泄露，為病毒防控工作持續(xù)開展打下基礎(chǔ)。
完成新冠病毒精準(zhǔn)分析報(bào)告，為病毒溯源和疫情防控提供重要決策輔助工作，交付初期已在國(guó)內(nèi)10個(gè)最大地方分部同步運(yùn)行。
建設(shè)內(nèi)容
搭建了食源性微生物菌株的毒力檢測(cè)及溯源系統(tǒng)，對(duì)菌株的危害性以及傳播關(guān)系進(jìn)行深入分析。 系統(tǒng)通過對(duì)食源性微生物菌株二代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組組裝及后續(xù)溯源分析，實(shí)現(xiàn)菌株MLST與cgMLST位點(diǎn)序列庫(kù)建庫(kù)，以及數(shù)據(jù)加載分析，并提供定制報(bào)告。
建設(shè)成果
結(jié)合院士科研理論開發(fā)的業(yè)務(wù)系統(tǒng)，解決了致病微生物隱秘傳播過程難以準(zhǔn)確跟蹤的問題，可應(yīng)用與環(huán)境監(jiān)測(cè)和食品安全領(lǐng)域。
系統(tǒng)同時(shí)落地應(yīng)用在醫(yī)院臨床有害菌病毒來源檢測(cè)、工業(yè)生產(chǎn)環(huán)節(jié)有害菌檢測(cè)以及動(dòng)物畜牧養(yǎng)殖過程的防疫檢測(cè)。
建設(shè)內(nèi)容
收錄十余種國(guó)內(nèi)外全方位的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。各數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)量：細(xì)菌 > 100,000種; 病毒 > 30,000種; 真菌 > 2,000種; 寄生蟲 > 2,000種，完成病原體生物遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)的初始建庫(kù)工作，通過將序列與已有數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，實(shí)現(xiàn)未知病原體到“種水平”的識(shí)別。
建設(shè)成果
依托現(xiàn)有軟件平臺(tái)，在極低建設(shè)和學(xué)習(xí)成本的情況下，擴(kuò)大了單位病原體的監(jiān)測(cè)范圍，增強(qiáng)了團(tuán)隊(duì)的生信分析能力。
整合單位不同研究團(tuán)隊(duì)的數(shù)據(jù)、流程等資源，作為共同協(xié)作平臺(tái)提高了單位應(yīng)對(duì)突發(fā)未知疫情的防控能力。