- 生物大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)
- 生信一體機(jī)
- 生物超算中心
- 生信實(shí)訓(xùn)平臺(tái)
生物大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)
覆蓋項(xiàng)目的始與終，明領(lǐng)基因結(jié)合自主研發(fā)的GOS數(shù)據(jù)管理軟件與硬件設(shè)備，推出生物數(shù)據(jù)保險(xiǎn)柜，圍繞生物信息打造智能化科研生態(tài)環(huán)境。
安全
生物數(shù)據(jù)加密技術(shù)
搭載四大自研生物數(shù)據(jù)專利技術(shù)，已應(yīng)用于大量產(chǎn)品，其中25個(gè)獲軟件著作權(quán)
資源安全
本地化存儲(chǔ)，陣列備份方案可靠性達(dá)到99.9999%
四大專利及25個(gè)軟件著作權(quán)
高性價(jià)比
獨(dú)有專利的高效GOS壓縮算法，支持壓縮不同類型數(shù)據(jù)，100G數(shù)據(jù)平均可壓縮至10G，直接降低單TB存儲(chǔ)成本。與普通產(chǎn)品相比，GOS存儲(chǔ)可節(jié)省83.31%成本。
| 數(shù)據(jù)類型 | Vcf | Fastq | Sam |
| GOS壓縮比 | 30:1 | 25:1 | 8:1 |
| 100TB可存原始數(shù)據(jù)量（TB） | 3000 | 2500 | 800 |
數(shù)據(jù)壓縮比平均達(dá)10:1
| 存儲(chǔ)類型 | 1000TB原始數(shù)據(jù)5年存儲(chǔ)成本 |
| GOS壓縮比 | 11.99 萬元 |
| 普通 | 71.86 萬元 |
GOS比普通存儲(chǔ)最高節(jié)省8.3倍成本
便捷
為貼合用戶習(xí)慣，產(chǎn)品提供web端和命令端管理頁面，帶來流暢、便捷的使用體驗(yàn)。
產(chǎn)品形態(tài)
| 類型 | 適用 | 應(yīng)用效果 | 圖示 |
|---|---|---|---|
| 存儲(chǔ)管理一體機(jī) | 個(gè)人或人數(shù)較少團(tuán)隊(duì)，短時(shí)間內(nèi)不產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)。 | 成本投入最小，通過增加硬盤擴(kuò)容，短時(shí)間內(nèi)無需購(gòu)買新的硬件設(shè)備。 |
|
| 存儲(chǔ)集群 | 大中型團(tuán)隊(duì)，開展多個(gè)項(xiàng)目的首選。 | 協(xié)助PI統(tǒng)一管理多個(gè)項(xiàng)目的數(shù)據(jù)，適應(yīng)團(tuán)隊(duì)不斷增長(zhǎng)的存儲(chǔ)需求。 |
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| 大數(shù)據(jù)中心 | 大型科研機(jī)構(gòu)，有多部門開展大規(guī)模項(xiàng)目。 | 保障數(shù)據(jù)安全的同時(shí)，服務(wù)不同部門項(xiàng)目，開放內(nèi)部共享，沉淀數(shù)據(jù)資產(chǎn)。 |
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用戶范圍
明領(lǐng)基因擁有豐富的服務(wù)和實(shí)施經(jīng)驗(yàn)，存儲(chǔ)產(chǎn)品已覆蓋在上百家政府單位、科研機(jī)構(gòu)、高校、醫(yī)院和生物企業(yè)中。
國(guó)家單位機(jī)構(gòu)
- 醫(yī)療與生物類檢測(cè)中心
- 疾病預(yù)防控制中心
- 全國(guó)各海關(guān)
- 公安部門
- 食安檢定部門
高?？蒲性核?
- 各大高校的研究團(tuán)隊(duì)
- 各省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
- 各省微生物所
- 生物工程所
- 環(huán)境研究所
生物相關(guān)企業(yè)
- 動(dòng)植物育種企業(yè)
- 畜牧企業(yè)
- 第三方檢測(cè)公司
- 測(cè)序試劑等耗材廠家
- 設(shè)備廠家
醫(yī)療數(shù)據(jù)中心
- 醫(yī)院
- 精準(zhǔn)醫(yī)療中心
- 醫(yī)藥研發(fā)中心
- 醫(yī)療檢驗(yàn)部門等
GOS生信分析一體機(jī)
GOS（GenOneS）生信分析一體機(jī)，是明領(lǐng)基因開發(fā)的一款便捷易用、降本高效，專注于生物信息領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)工作站。
應(yīng)用場(chǎng)景
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
預(yù)裝Linux操作系統(tǒng)，常用系統(tǒng)庫(kù)文件、主流分析流程和工具，使用和學(xué)習(xí)門檻將大大降低。
| 操作系統(tǒng) | centos 7 （穩(wěn)定性比Ubuntu更強(qiáng)） |
| 內(nèi)置十多項(xiàng)分析流程；開機(jī)即用，傻瓜式操作，一鍵化得到分析結(jié)果 | 遺傳變異分析流程、mRNA轉(zhuǎn)錄組分析流程、全轉(zhuǎn)錄組分析流程、miRNA轉(zhuǎn)錄組分析流程、BS-seq分析流程、ChCP-seq分析流程、翻譯組分析流程、蛋白組分析流程、代謝組分析流程、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析流程、菌株庫(kù)分析流程、宏基因組分析流程和自定義分析流程。 |
| 內(nèi)置三十多個(gè)生物信息學(xué)分析軟件 | Fastp、Bowtie2、Bedtools、Python、R、Java、BLAST、Kaiju、Trimmomatic、Gatk、Fastqc、Megahit、BamToFastq、Docker、Gmhmmp、Cd-hit、BWA、samtools、Diamond、Soap、Cutadapt、humann2 等。 |
| 包管理器，輕松實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化 |
rpm應(yīng)用程序管理器 開源生信軟件管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)conda |
純國(guó)產(chǎn)軟件
國(guó)外相關(guān)產(chǎn)品無版權(quán)關(guān)系，數(shù)據(jù)的分析不依賴現(xiàn)有的國(guó)外相關(guān)平臺(tái)，能夠?qū)崿F(xiàn)完全自主分析。
本地化積累
不依賴國(guó)外數(shù)據(jù)庫(kù)，對(duì)科學(xué)研究中的數(shù)據(jù)、流程、報(bào)告進(jìn)行完整的保存和沉淀，幫助科研人員驗(yàn)證試驗(yàn)和結(jié)果重現(xiàn)。
降本增效
能夠通過測(cè)序數(shù)據(jù)的無損壓縮等技術(shù)，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)高效存儲(chǔ)，降低數(shù)據(jù)持有成本。
信息安全
防入侵：保證數(shù)據(jù)不被非法獲取。
防損壞：自動(dòng)還原被誤刪破損的信息，防止人為操作意外。
底層容器：保障運(yùn)行時(shí)的數(shù)據(jù)安全、信息安全和環(huán)境兼容。
高效的分布式計(jì)算
基于容器技術(shù)的智能調(diào)度并行計(jì)算，最前沿并最合適的基因計(jì)算模式。不再受制于主服務(wù)器的吞吐量，且遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于并發(fā)執(zhí)行多個(gè)小任務(wù)的基因計(jì)算。
圖形化與命令行并存
操作場(chǎng)景完善——圖形化流程滿足大規(guī)模生產(chǎn)應(yīng)用，命令行滿足科研人員高端開發(fā)。
案例分享
搭建省生物工程研究所工作站
建立國(guó)家食品安全數(shù)據(jù)庫(kù)
生物超算中心 – 將高性能服務(wù)器與生信工具相結(jié)合，提供分布式計(jì)算和強(qiáng)大的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng)。
功能介紹
數(shù)據(jù)安全
基于容器技術(shù)將生物分析的數(shù)據(jù)封裝到特定容器中，并使用更實(shí)用的安全策略保證容器內(nèi)數(shù)據(jù)的機(jī)密性，完整性。
資源安全
計(jì)算資源和存儲(chǔ)資源按需分配給各個(gè)生物分析流程，通過虛擬化技術(shù)保證分析流程無法超額使用資源。
環(huán)境沖突
對(duì)生信分析組件實(shí)施分區(qū)管理，減少生信軟件間的沖突，提高生信分析軟件之間的兼容性。
架構(gòu)介紹
物種數(shù)據(jù)庫(kù)功能
進(jìn)化樹
抓取功能
解析功能
查看導(dǎo)出功能
案例分享
廣東省微生物研究所食源性菌株公開庫(kù)
明領(lǐng)基因?yàn)閺V東省微生物研究所開發(fā)食源性菌株公開庫(kù)服務(wù)平臺(tái)，對(duì)外提供包括基于blast的序列檢索、地圖展示微生物信息、病原微生物菌株分型、進(jìn)化樹生成、檢索和基因組數(shù)據(jù)提交等功能。打造一個(gè)具備國(guó)內(nèi)和國(guó)際影響力的食源性微生物公共服務(wù)數(shù)據(jù)庫(kù)，擴(kuò)大廣東省微生物研究所里的行業(yè)知名度和競(jìng)爭(zhēng)力，進(jìn)一步提高廣東省微生物研究所的研究水平和科研服務(wù)能力。
案例分享
廣東省微生物所高性能計(jì)算中心
GOS系統(tǒng)結(jié)合高性能計(jì)算機(jī)集群和數(shù)十種生信工具共同為廣東省微生物研究所提供超算運(yùn)算能力和數(shù)據(jù)存儲(chǔ)，具有數(shù)據(jù)保護(hù)的安全性，超算使用的便利性跟所里實(shí)際業(yè)務(wù)運(yùn)營(yíng)的高契合度三大特點(diǎn)。
生信實(shí)訓(xùn)平臺(tái)–結(jié)合生信數(shù)據(jù)存儲(chǔ)分析平臺(tái)和教學(xué)平臺(tái)于一體的實(shí)訓(xùn)平臺(tái)。
結(jié)合生信數(shù)據(jù)存儲(chǔ)分析與生信教學(xué)與一體的實(shí)訓(xùn)平臺(tái)，以GOS系統(tǒng)為核心的生信實(shí)訓(xùn)平臺(tái)孕育而生。
平臺(tái)特點(diǎn)
可服務(wù)于科研
流程科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)，數(shù)據(jù)分析結(jié)果可重現(xiàn)可驗(yàn)證
實(shí)訓(xùn)內(nèi)容豐富
自帶超過20TB原始數(shù)據(jù)，20多種分析流程
培訓(xùn)體系豐富
從基礎(chǔ)分析到高級(jí)分析，完善的培訓(xùn)體系貫穿整個(gè)學(xué)習(xí)生涯
貼合教學(xué)設(shè)計(jì)
根據(jù)不同專業(yè)實(shí)訓(xùn)需求，設(shè)置相關(guān)實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目類型
案例分享
華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生信實(shí)訓(xùn)平臺(tái)
作為生命科學(xué)研究的前沿領(lǐng)域，生物信息學(xué)已經(jīng)是一門支柱性學(xué)科，而國(guó)內(nèi)外對(duì)生信工程師的人才需求也快速上升，華南農(nóng)大對(duì)其十分重視，將其設(shè)為學(xué)分制學(xué)科，并使用明領(lǐng)基因自主研發(fā)的生信實(shí)訓(xùn)平臺(tái)作為教學(xué)工具，該平臺(tái)是國(guó)內(nèi)首套從生物數(shù)據(jù)存儲(chǔ)到流程配置應(yīng)用一體的高效平臺(tái)，亦滿足生信教學(xué)所需的實(shí)訓(xùn)演示、作業(yè)發(fā)布等功能，培訓(xùn)體系完善，貼合教學(xué)設(shè)計(jì)，解決從課程學(xué)習(xí)到實(shí)際應(yīng)用完美過渡教學(xué)需求，在課堂中應(yīng)用收獲一致好評(píng)。